Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd5Q5VCS6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd5Q5VCS6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd5Q5VCS6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd5Q5VCS6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd5Q5VCS6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd5Q5VCS6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd5Q5VCS6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd5Q5VCS6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd5Q5VCS6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd5Q5VCS6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd5Q5VCS6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd5Q5VCS6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd5Q5VCS6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd5Q5VCS6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd5Q5VCS6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd5Q5VCS6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd5Q5VCS6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd5Q5VCS6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd5Q5VCS6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd5Q5VCS6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd5Q5VCS6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd5Q5VCS6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd5Q5VCS6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd5Q5VCS6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd5Q5VCS6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd5Q5VCS6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd5Q5VCS6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd5Q5VCS6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd5Q5VCS6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms