Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NotoQ5TIS6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms