Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Psme4Q5SSW2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms