Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RilpQ5ND29 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RilpQ5ND29 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RilpQ5ND29 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RilpQ5ND29 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RilpQ5ND29 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RilpQ5ND29 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RilpQ5ND29 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RilpQ5ND29 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RilpQ5ND29 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RilpQ5ND29 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RilpQ5ND29 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RilpQ5ND29 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RilpQ5ND29 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RilpQ5ND29 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RilpQ5ND29 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RilpQ5ND29 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RilpQ5ND29 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RilpQ5ND29 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RilpQ5ND29 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms