Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1810065E05RikQ5NC41 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
1810065E05RikQ5NC41 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
1810065E05RikQ5NC41 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1810065E05RikQ5NC41 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1810065E05RikQ5NC41 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1810065E05RikQ5NC41 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1810065E05RikQ5NC41 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1810065E05RikQ5NC41 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1810065E05RikQ5NC41 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1810065E05RikQ5NC41 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1810065E05RikQ5NC41 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1810065E05RikQ5NC41 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1810065E05RikQ5NC41 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1810065E05RikQ5NC41 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
1810065E05RikQ5NC41 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1810065E05RikQ5NC41 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1810065E05RikQ5NC41 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1810065E05RikQ5NC41 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1810065E05RikQ5NC41 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1810065E05RikQ5NC41 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
1810065E05RikQ5NC41 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms