Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8N4

Sdr39u1, Epimerase family protein SDR39U1, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr39u1Q5M8N4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
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Sdr39u1Q5M8N4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdr39u1Q5M8N4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Sdr39u1Q5M8N4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Sdr39u1Q5M8N4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sdr39u1Q5M8N4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sdr39u1Q5M8N4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sdr39u1Q5M8N4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sdr39u1Q5M8N4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sdr39u1Q5M8N4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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