Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eme2Q56A04 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Eme2Q56A04 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Eme2Q56A04 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Eme2Q56A04 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Eme2Q56A04 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eme2Q56A04 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Eme2Q56A04 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Eme2Q56A04 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Eme2Q56A04 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Eme2Q56A04 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Eme2Q56A04 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Eme2Q56A04 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eme2Q56A04 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eme2Q56A04 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eme2Q56A04 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms