Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1qtnf9Q4ZJN1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms