Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ddx49Q4FZF3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddx49Q4FZF3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx49Q4FZF3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx49Q4FZF3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx49Q4FZF3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx49Q4FZF3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx49Q4FZF3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx49Q4FZF3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx49Q4FZF3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx49Q4FZF3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms