Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SfswapQ3USH5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SfswapQ3USH5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms