Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cobll1Q3UMF0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cobll1Q3UMF0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cobll1Q3UMF0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cobll1Q3UMF0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cobll1Q3UMF0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cobll1Q3UMF0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cobll1Q3UMF0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cobll1Q3UMF0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cobll1Q3UMF0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cobll1Q3UMF0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms