Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc61Q3UJV1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc61Q3UJV1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms