Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc58Q3UGP9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc58Q3UGP9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms