Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp36Q3UFY0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp36Q3UFY0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms