Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Garem1Q3UFT3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Garem1Q3UFT3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms