Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3U7U4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3U7U4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q3U7U4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q3U7U4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3U7U4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U7U4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U7U4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U7U4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U7U4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U7U4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U7U4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U7U4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U7U4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U7U4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms