Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U6N9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U6N9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3U6N9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3U6N9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3U6N9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3U6N9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3U6N9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3U6N9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms