Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U1D9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U1D9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U1D9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3U1D9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3U1D9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3U1D9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3U1D9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Q3U1D9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U1D9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U1D9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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