Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Lrrn4clQ3TYX2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lrrn4clQ3TYX2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Lrrn4clQ3TYX2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Lrrn4clQ3TYX2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Lrrn4clQ3TYX2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn4clQ3TYX2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms