Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf3c3Q3TMP1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms