Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms