Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VrtnQ3SYK4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VrtnQ3SYK4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms