Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
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Lingo4Q149C3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Lingo4Q149C3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Lingo4Q149C3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Lingo4Q149C3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Lingo4Q149C3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Lingo4Q149C3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Lingo4Q149C3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Lingo4Q149C3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Lingo4Q149C3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Lingo4Q149C3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lingo4Q149C3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
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Lingo4Q149C3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Lingo4Q149C3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Lingo4Q149C3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Lingo4Q149C3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lingo4Q149C3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Lingo4Q149C3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lingo4Q149C3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lingo4Q149C3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lingo4Q149C3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lingo4Q149C3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lingo4Q149C3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lingo4Q149C3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lingo4Q149C3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lingo4Q149C3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lingo4Q149C3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lingo4Q149C3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Lingo4Q149C3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms