Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab42Q0PD08 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms