Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn2bQ0KL01 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms