Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Znf541Q0GGX2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Znf541Q0GGX2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms