Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnnm1Q0GA42 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms