Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calb2Q08331 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms