Protein–RNA interactions for Protein: Q05CL8

Larp7, La-related protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp7Q05CL8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Larp7Q05CL8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Larp7Q05CL8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Larp7Q05CL8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Larp7Q05CL8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Larp7Q05CL8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Larp7Q05CL8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Larp7Q05CL8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Larp7Q05CL8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Larp7Q05CL8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Larp7Q05CL8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Larp7Q05CL8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Larp7Q05CL8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Larp7Q05CL8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms