Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a1Q05722 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms