Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Fgfr4Q03142 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgfr4Q03142 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms