Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme2Q01768 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms