Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SelpQ01102 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SelpQ01102 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SelpQ01102 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SelpQ01102 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SelpQ01102 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SelpQ01102 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SelpQ01102 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SelpQ01102 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SelpQ01102 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SelpQ01102 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SelpQ01102 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SelpQ01102 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SelpQ01102 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SelpQ01102 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms