Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms