Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou1f1Q00286 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms