Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cds1P98191 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cds1P98191 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cds1P98191 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cds1P98191 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cds1P98191 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cds1P98191 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cds1P98191 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cds1P98191 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cds1P98191 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cds1P98191 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cds1P98191 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cds1P98191 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cds1P98191 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms