Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lama4P97927 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lama4P97927 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lama4P97927 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lama4P97927 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lama4P97927 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Lama4P97927 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lama4P97927 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lama4P97927 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lama4P97927 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms