Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LystP97412 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LystP97412 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LystP97412 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LystP97412 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LystP97412 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LystP97412 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LystP97412 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LystP97412 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LystP97412 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LystP97412 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LystP97412 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LystP97412 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LystP97412 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LystP97412 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LystP97412 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LystP97412 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LystP97412 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LystP97412 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LystP97412 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LystP97412 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LystP97412 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LystP97412 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LystP97412 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LystP97412 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LystP97412 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LystP97412 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LystP97412 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LystP97412 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LystP97412 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LystP97412 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LystP97412 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LystP97412 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LystP97412 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LystP97412 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LystP97412 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LystP97412 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LystP97412 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LystP97412 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LystP97412 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LystP97412 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LystP97412 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LystP97412 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LystP97412 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LystP97412 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LystP97412 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LystP97412 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LystP97412 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LystP97412 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LystP97412 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LystP97412 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LystP97412 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LystP97412 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LystP97412 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LystP97412 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LystP97412 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LystP97412 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LystP97412 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LystP97412 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LystP97412 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LystP97412 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LystP97412 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LystP97412 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LystP97412 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LystP97412 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LystP97412 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LystP97412 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LystP97412 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LystP97412 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LystP97412 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LystP97412 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LystP97412 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LystP97412 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LystP97412 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LystP97412 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LystP97412 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LystP97412 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LystP97412 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LystP97412 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LystP97412 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LystP97412 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LystP97412 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LystP97412 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LystP97412 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LystP97412 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LystP97412 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LystP97412 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LystP97412 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LystP97412 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LystP97412 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LystP97412 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LystP97412 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LystP97412 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LystP97412 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LystP97412 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LystP97412 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LystP97412 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LystP97412 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LystP97412 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LystP97412 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms