Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SmsP97355 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SmsP97355 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SmsP97355 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SmsP97355 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SmsP97355 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SmsP97355 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SmsP97355 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SmsP97355 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SmsP97355 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SmsP97355 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SmsP97355 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SmsP97355 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SmsP97355 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SmsP97355 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SmsP97355 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SmsP97355 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SmsP97355 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SmsP97355 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SmsP97355 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SmsP97355 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SmsP97355 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SmsP97355 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SmsP97355 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SmsP97355 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SmsP97355 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SmsP97355 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SmsP97355 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SmsP97355 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SmsP97355 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SmsP97355 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SmsP97355 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SmsP97355 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SmsP97355 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SmsP97355 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SmsP97355 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SmsP97355 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SmsP97355 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SmsP97355 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SmsP97355 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SmsP97355 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SmsP97355 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SmsP97355 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SmsP97355 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SmsP97355 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SmsP97355 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SmsP97355 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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SmsP97355 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SmsP97355 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SmsP97355 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SmsP97355 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SmsP97355 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SmsP97355 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SmsP97355 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SmsP97355 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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SmsP97355 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SmsP97355 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SmsP97355 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SmsP97355 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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SmsP97355 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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SmsP97355 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SmsP97355 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SmsP97355 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SmsP97355 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SmsP97355 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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SmsP97355 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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SmsP97355 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SmsP97355 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SmsP97355 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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SmsP97355 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SmsP97355 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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SmsP97355 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SmsP97355 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SmsP97355 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SmsP97355 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SmsP97355 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SmsP97355 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SmsP97355 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SmsP97355 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SmsP97355 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SmsP97355 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SmsP97355 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SmsP97355 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SmsP97355 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SmsP97355 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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