Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkp1P97350 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp1P97350 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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