Protein–RNA interactions for Protein: P84444

Ccl21a, C-C motif chemokine 21a, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21aP84444 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl21aP84444 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl21aP84444 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl21aP84444 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl21aP84444 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl21aP84444 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl21aP84444 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl21aP84444 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl21aP84444 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl21aP84444 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl21aP84444 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl21aP84444 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl21aP84444 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl21aP84444 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl21aP84444 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl21aP84444 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl21aP84444 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl21aP84444 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl21aP84444 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl21aP84444 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl21aP84444 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl21aP84444 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms