Protein–RNA interactions for Protein: P82350

Sgca, Alpha-sarcoglycan, mousemouse

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcaP82350 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcaP82350 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcaP82350 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcaP82350 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcaP82350 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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