Protein–RNA interactions for Protein: P81269

Atf1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf1P81269 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf1P81269 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf1P81269 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf1P81269 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf1P81269 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf1P81269 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf1P81269 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf1P81269 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf1P81269 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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