Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shox2P70390 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shox2P70390 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Shox2P70390 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shox2P70390 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shox2P70390 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shox2P70390 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shox2P70390 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Shox2P70390 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shox2P70390 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Shox2P70390 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Shox2P70390 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shox2P70390 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shox2P70390 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms