Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SbdsP70122 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SbdsP70122 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SbdsP70122 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SbdsP70122 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SbdsP70122 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SbdsP70122 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SbdsP70122 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SbdsP70122 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SbdsP70122 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SbdsP70122 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SbdsP70122 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SbdsP70122 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SbdsP70122 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SbdsP70122 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms