Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ActbP60710 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ActbP60710 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ActbP60710 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ActbP60710 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ActbP60710 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ActbP60710 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ActbP60710 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ActbP60710 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ActbP60710 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ActbP60710 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ActbP60710 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ActbP60710 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ActbP60710 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ActbP60710 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ActbP60710 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ActbP60710 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ActbP60710 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ActbP60710 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ActbP60710 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ActbP60710 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ActbP60710 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ActbP60710 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ActbP60710 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ActbP60710 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ActbP60710 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ActbP60710 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ActbP60710 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ActbP60710 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ActbP60710 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ActbP60710 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ActbP60710 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ActbP60710 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ActbP60710 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ActbP60710 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ActbP60710 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ActbP60710 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ActbP60710 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ActbP60710 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ActbP60710 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ActbP60710 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ActbP60710 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ActbP60710 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ActbP60710 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ActbP60710 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ActbP60710 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ActbP60710 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ActbP60710 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ActbP60710 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ActbP60710 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ActbP60710 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ActbP60710 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ActbP60710 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ActbP60710 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ActbP60710 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ActbP60710 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ActbP60710 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ActbP60710 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ActbP60710 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ActbP60710 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ActbP60710 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ActbP60710 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ActbP60710 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ActbP60710 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ActbP60710 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ActbP60710 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ActbP60710 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ActbP60710 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ActbP60710 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ActbP60710 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ActbP60710 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ActbP60710 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ActbP60710 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ActbP60710 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ActbP60710 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ActbP60710 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ActbP60710 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ActbP60710 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ActbP60710 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ActbP60710 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ActbP60710 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ActbP60710 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ActbP60710 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ActbP60710 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ActbP60710 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ActbP60710 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ActbP60710 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ActbP60710 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ActbP60710 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ActbP60710 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ActbP60710 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ActbP60710 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ActbP60710 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ActbP60710 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ActbP60710 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ActbP60710 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ActbP60710 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ActbP60710 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ActbP60710 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ActbP60710 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms