Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps33bP59016 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms