Protein–RNA interactions for Protein: P58749

Tm6sf1, Transmembrane 6 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm6sf1P58749 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tm6sf1P58749 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms