Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tm9sf2P58021 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tm9sf2P58021 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tm9sf2P58021 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm9sf2P58021 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms