Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TdgP56581 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TdgP56581 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TdgP56581 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TdgP56581 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TdgP56581 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TdgP56581 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TdgP56581 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TdgP56581 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TdgP56581 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TdgP56581 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TdgP56581 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TdgP56581 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TdgP56581 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TdgP56581 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TdgP56581 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TdgP56581 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TdgP56581 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TdgP56581 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TdgP56581 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TdgP56581 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TdgP56581 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TdgP56581 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TdgP56581 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TdgP56581 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TdgP56581 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TdgP56581 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TdgP56581 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TdgP56581 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TdgP56581 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TdgP56581 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TdgP56581 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TdgP56581 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TdgP56581 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TdgP56581 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TdgP56581 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TdgP56581 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TdgP56581 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TdgP56581 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TdgP56581 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TdgP56581 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TdgP56581 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TdgP56581 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TdgP56581 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TdgP56581 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TdgP56581 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TdgP56581 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TdgP56581 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TdgP56581 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TdgP56581 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TdgP56581 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TdgP56581 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TdgP56581 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TdgP56581 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TdgP56581 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TdgP56581 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TdgP56581 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TdgP56581 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TdgP56581 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TdgP56581 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TdgP56581 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TdgP56581 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TdgP56581 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TdgP56581 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TdgP56581 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TdgP56581 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TdgP56581 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TdgP56581 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TdgP56581 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TdgP56581 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TdgP56581 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TdgP56581 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TdgP56581 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TdgP56581 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TdgP56581 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TdgP56581 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TdgP56581 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TdgP56581 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TdgP56581 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TdgP56581 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TdgP56581 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TdgP56581 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TdgP56581 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TdgP56581 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
TdgP56581 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
TdgP56581 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TdgP56581 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TdgP56581 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TdgP56581 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TdgP56581 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TdgP56581 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TdgP56581 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TdgP56581 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TdgP56581 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TdgP56581 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TdgP56581 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TdgP56581 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TdgP56581 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TdgP56581 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TdgP56581 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms